AI 在湿实验里学会化学了吗?Leash Bio 把 5,000 次筛选做成推理沙盒
药物发现模型可能靠记住实验者和数据中的线索得高分,却没有学会分子与蛋白怎样相互作用。
导读
药物发现模型可能靠记住实验者和数据中的线索得高分,却没有学会分子与蛋白怎样相互作用。Leash Bio 的 Ian Quigley 介绍,团队一边扩大湿实验数据,一边设计更难的拆分和干预,让模型不能轻易沿用这些捷径。一次竞赛中,模型在与训练集共享构件的分子上有所提升;换成骨架、构件和连接方式都不同的库后,没有队伍优于随机。团队后来发现模型靠蛋白上一小段序列识别身份,于是改变结合口袋中的氨基酸并重新筛选,让相似蛋白产生不同实验结果,再用于训练。Leash 还把已测数据做成快速实验沙盒,让 Agent 提出结构假设、选择分子并根据测量反馈继续调整。Ian 说团队一个周末跑了超过一万次优化过程,但这些选择仍限于已筛过的分子;模型能否可靠推到未测化学空间,仍待检验。